许多成功的药物都起源于植物、真菌和细菌等天然来源,但筛选天然产物以鉴定潜在药物仍然是一项艰巨的任务。
根据 11 月 30 日发表在美国国家科学院院刊上的一项研究,一种使用分子生物学、分析化学和生物信息学来整合来自不同筛选平台的信息的新方法解决了天然产物药物发现中的一些最大挑战。
一个主要的挑战是确定新型生物活性化合物的作用机制和生物靶点。另一个主要挑战是在自然界的复杂混合物中识别驱动生物活性的分子。
这两个重要概念一直是我们合作计划的核心,本文以完全集成的方式将这两个问题结合在一起。”
John MacMillan,通讯作者,加州大学圣克鲁兹分校化学与生物化学教授
除了 MacMillan 之外,此次合作还包括加州大学圣克鲁斯分校化学与生物化学教授兼化学筛选中心主任 Scott Lokey、不列颠哥伦比亚省西蒙弗雷泽大学的 Roger Linington 和德克萨斯大学西南医学中心的 Michael White。
通过整合两个完全不同的筛选平台的结果,并将其与天然产物库的下一代代谢组学分析相结合,研究人员创建了一个独特而强大的天然产物生物学表征框架。使用这种方法筛选一小部分随机选择的微生物天然产物组分,他们能够鉴定出一种已知化合物(曲古抑菌素 A)并确认其作用机制;将已知化合物(surugamide)与新的生物活性(细胞周期蛋白依赖性激酶抑制)联系起来;并发现具有复杂生物活性的新化合物(帕卡霉素 A 和 B)。
MacMillan 说:“找到一种按预期分组的已知化合物告诉我们它正在起作用,然后我们就能够将一种已知化合物与一种新的作用机制联系起来。”“最后,我们发现了一种新的化合物,它具有不同于任何已知化合物的独特生物学特征。这是一个令人兴奋的发现,我们想进一步研究。”
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