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研究人员开发出一种可视化单细胞数据的工具

导读 现代尖端研究会产生大量数据,科学家面临着可视化和分析这些数据的挑战。维尔茨堡亥姆霍兹 RNA 感染研究所 (HIRI) 和维尔茨堡-施韦因富...

现代尖端研究会产生大量数据,科学家面临着可视化和分析这些数据的挑战。维尔茨堡亥姆霍兹 RNA 感染研究所 (HIRI) 和维尔茨堡-施韦因富特应用技术大学 (THWS) 的研究人员开发了一种可视化大型数据集的工具。

sCIRCLE 工具允许用户以交互且用户友好的方式探索单细胞分析数据。他们的研究结果已发表在《NAR 基因组学和生物信息学》杂志上。

抗生素耐药性在世界范围内不断增加,对医疗保健系统构成了重大挑战。了解某些细菌如何以及为何产生这种防御机制的根本过程至关重要。

细菌基因表达的差异(读取基因中的信息)可以提供线索。

细菌单细胞 RNA 测序(或称“scRNA-seq”)已成为分析这些变异的重要工具。该技术提供了特定时间点单个细胞中基因表达的详细图像。然而,该方法会产生大量数据,研究人员很难对其进行可视化和分析。

因此,迫切需要新的方法和工具来显示和理解这些信息。

位于维尔茨堡的亥姆霍兹 RNA 感染研究中心 (HIRI) 的研究人员(位于不伦瑞克的亥姆霍兹感染研究中心 (HZI) 与维尔茨堡大学 (JMU) 的合作基地)以及维尔茨堡-施韦因富特应用技术大学 (THWS) 的设计师现已开发出这样一种工具。

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