导读 对改善植物特定性状感兴趣的研究人员现在无需进行任何实验即可识别调节该性状表达的基因。普渡大学的 Kranthi Varala 和 10 位合著者...
对改善植物特定性状感兴趣的研究人员现在无需进行任何实验即可识别调节该性状表达的基因。
普渡大学的 Kranthi Varala 和 10 位合著者在《美国国家科学院院刊》上发表了新的基于网络的调控基因发现工具的详细信息。 Varala 正在申请一项专利，该专利与经济上重要的种子油生物合成相关。
普渡大学-美国农业部团队试图建立一个资源，从大量公开数据中学习，快速识别哪些称为转录因子的特殊基因调节各种植物物种中给定性状的表达。
“每项研究都集中在其中的少数几个，”园艺和景观建筑学助理教授瓦拉拉说。 “我们的前提是，如果我们能够将所有数据放入单一分析中，那么我们就可以使用这些数据来构建全球性的东西。”
拟南芥作为PNAS研究的模型植物，“但这种方法与拟南芥没有任何特异性，”瓦拉拉说。 “这种方法足够通用，你可以从玉米数据集开始。你可以用水稻、番茄，无论你正在种植的任何作物，只要你有人们已经完成的数千个基因表达测量。现在我们对十多个物种进行了数以万计的基因表达研究。”
为了证明该系统有效，该团队专注于调节植物如何在种子中制造和储存油的遗传途径。研究小组之所以选择这种性状，是因为它在食品和生物燃料生产中的重要性，而且涉及的 300 多个基因已经为人所知。
通过基因操纵植物的转录因子，研究人员可以增加或减少其种子中产生的油量。
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