来自 Sinai Health 的研究人员发表了一项研究,该研究提供了对活体人体细胞组织的超详细研究,提供了一种新工具,可以帮助世界各地的科学家更好地了解疾病期间发生的情况。
今天发表在《自然》杂志上的这项新研究是在 Anne-Claude Gingras 博士的实验室进行的,他是 Lunenfeld-Tanenbaum 研究所 (LTRI) 的高级研究员,也是多伦多大学分子遗传学系的教授.
共同第一作者 Christopher Go 和 James Knight 博士使用 192 个已知存在于特定细胞器中的蛋白质的标记调查了人类细胞景观,这些蛋白质可以“标记”同一隔室中的相邻蛋白质。
“人类细胞图谱能够预测 4,000 种蛋白质在活体人体细胞所有隔室中的定位,”Go 说。“我们对人体细胞的所有主要细胞器进行了采样,并使用创新分析创建了迄今为止最高分辨率的图谱,在预测许多未映射蛋白质的新定位方面具有很高的准确性。”
人体由数以万亿计的细胞组成,每个细胞都进一步分为具有特定功能的不同隔间,就像房子有不同的房间用于睡觉或准备食物一样。这些称为细胞器的隔室包含不同的蛋白质,执行与隔室相关的特定活动。线粒体,即所谓的细胞动力源,是细胞器的一个例子。
科学家们说,了解哪些蛋白质驻留在哪些细胞器中是了解每种细胞蛋白质作用的重要第一步。早期的方法通常使用先杀死细胞,然后再尝试将细胞器彼此分离的方法。
“以前,这就像把房子拆开来隔离每个单独的房间,”Go 说。“这些方法往往只提供细胞组织的粗略观点。”
Gingras 实验室开发了使用称为质谱仪的仪器检测蛋白质的工具。在这项新研究中,他们纯化了被细胞器标记“标记”的蛋白质,并通过质谱法鉴定了它们中的每一个。然后,该团队使用计算工具来重建人体细胞。
LTRI Gingras 实验室的生物信息学家 Knight 博士说:“通过我们的研究,我们已经表明,我们可以以相对较少的努力一次精确定位数千种蛋白质。”“以前定位蛋白质的方法需要单独研究每种蛋白质,或者需要有限的关注。”
鉴于人类细胞图谱的广泛性,该团队还创建了一个分析门户,让世界各地的研究人员能够更深入地研究数据。用户可以详细扫描 192 个标记中的每一个,并将他们自己的蛋白质定位数据与人类细胞图谱中的预测进行比较。
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