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宏基因组学揭示了蛤蜊的不同微生物类型

CRIOBE和ENTROPIE研究小组与大学太古海洋科学研究所、Kaushalong研究所和James Cook大学合作开展的新研究,重点是底栖物种组合对巨型蛤蜊的影响。研究结果最近发表在《微生物》杂志上。

无论气温是否升高,研究人员首次探索了底栖物种组合对巨蛤健康的影响。为此,他们用两种珊瑚(长角珊瑚和大孔珊瑚)和一只巨大的蛤蜊创建了人工底栖生物群落。结果表明,巨蛤的健康状况与邻近物种有关。此外,利用Xavier Pochon博士采用的前沿DNA复用-代谢组学编码技术,该团队研究了巨蛤的微生物群落。研究人员在研究的大鲵种群中发现了不同的微生物种类(一组特定的细菌),其中一种与蛤蜊的死亡率有关。

科学家们对巨型蛤蜊的研究很少,但它们是珊瑚礁的重要成员,发挥着许多生态作用。它们是现存最大的双壳类动物,也是鱼类和人类的食物。像珊瑚一样,它们通过单细胞藻类的光合作用促进初级生产。它们也有大量的细菌群落,以及虾或蟹等动物。但目前已确认的12个物种全部受到威胁,超过50%的野生种群要么局部灭绝,要么数量严重减少。

“几十年来,我们一直在关注气候变化对单个物种的影响,但这并不能反映整个珊瑚礁的可能情况。这就是为什么我们决定探索邻近物种对巨型蛤蜊的影响。我们非常惊讶地发现,一些珊瑚的存在,尤其是Arquero的pora cytherea,导致巨蛤对温度上升非常敏感,从而表现出很高的死亡率。”伊希斯吉伯特博士解释道。

微生物群落是多细胞生物的组成部分,对多细胞生物的健康和生理表现起着重要作用。科学家指出,尽管人们对这一研究领域的兴趣激增,但几乎没有人研究过无脊椎动物的微生物群。巨蛤的微生物群落特别有趣,因为蛤蜊可以通过滤食性接触到极其丰富多样的微生物。在次级水平上可以检测到的特定微生物群结构的发现是对无脊椎动物微生物类型的首次描述。“我们的结果表明,与人类相似,遗传因素可能会驱动巨型蛤蜊的微生物类型,”伊希斯吉伯特博士说。

有趣的是,受损的蛤蜊具有显著的弧菌特征,因此它们是一种独特的微生物群落。“在自然种群中,弧菌家族的相对比例可以作为贻贝健康的早期指标,”负责监督这项研究的veronique Berteaux-Lecellier博士解释说。“我们推测,胞囊藻可以分泌代谢产物,这可能会削弱贻贝抵抗弧菌感染的能力;未来的研究应该探索这种可能性。”这项研究的结果表明,珊瑚礁中底栖生物的组成和水温的上升可能对巨蛤和其他珊瑚礁生物的健康产生负面影响。因此,这些研究结果支持了这样的观点,即像陆地保护和恢复一样,考虑整个底栖动物群落应该是海洋保护战略的目标。

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