世界各地种植的甘薯是重要的营养来源，尤其是在撒哈拉以南非洲和亚洲饮食中。红薯对撒哈拉以南非洲地区尤其重要，因为它是维生素A的来源，而维生素A是该地区通常缺乏的营养物质。虽然中国目前是每个国家/地区生产最甜土豆的地区，但撒哈拉以南非洲有更多的土地种植红薯，并继续扩大产量。其他地方的农民也越来越多地种植红薯。
虽然红薯很重要，但对红薯微生物区系的了解却很少。昆虫学家布鲁克比斯辛格解释说：“植物的微生物群会深刻影响其健康和发育。”他最近在《植物生物群系杂志》发表了一篇关于甘薯的研究。“我们试图通过描述甘薯在实际工作农场和农场之间的特性，更好地了解甘薯的微生物群落。”
Bissinger和他的同事为AgBiome工作，AgBiome是一种由比尔梅林达盖茨基金会资助的生物，旨在识别和开发有益微生物，保护发展中国家的红薯免受昆虫侵害。他们利用这个机会来描述甘薯微生物区系的特征，以便为他们的项目和其他对类似工作感兴趣的研究人员提供信息。
他们发现，与更受欢迎的作物相似，甘薯微生物群遵循两步发展模式。
“我们已经证明了组成单一农场的甘薯微生物区系中微生物的惊人变化。尽管发生了这种变化，但我们发现了微生物组在一个红薯农场和同一地区的两个农场的领域中如何发展的共性，”该论文的主要作者、微生物组数据科学家查尔斯佩佩-兰尼(Charles Pepe-Ranney)说。
这是第一次使用现代下一代测序技术来表征甘薯微生物区系，这是利用微生物区系提高甘薯产量的重要第一步。
佩佩-兰尼说：“同样值得注意的是，我们的研究表明，甘薯对其内生菌(生活在植物中的微生物)构成了强大的生态挑战。”“比如我们要开发一种能够保护红薯免受害虫侵害的红薯内生菌，这种对红薯有益的内生菌必须能够承受红薯本身强大的生态压力。”
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