细菌对所有动物的健康至关重要，在动物及其组织的进化中也起着重要作用。为了了解动物如何随着时间的推移与细菌共同进化，研究人员转向夏威夷短尾乌贼。
在本周发表在《美国国家科学院院刊》上的一项新研究中，由UConn分子和细胞生物学副教授斯潘塞尼霍姆领导的国际研究小组对这种小鱿鱼的基因组进行了测序，以确定其在共生中独特的进化足迹。产生如何遏制细菌线索的器官特别适合这种伙伴关系。
第一个鱿鱼基因组测序由尼霍姆、佛罗里达大学的杰米福斯特、维也纳大学的奥列格西马科夫和夏威夷大学的迈赫迪贝尔凯德完成。比如团队发现了一些惊喜，那就是夏威夷短尾鱿鱼的基因组大小是人类基因组的1.5倍。
通过比较E. scolopes和它的近亲章鱼的基因组，研究人员发现章鱼和夏威夷短尾鱿鱼的共同祖先经历了一次重大的基因改造、重组，基因组尺寸增大。这种“升级”可能会让头足类动物更容易增加复杂性，包括含有细菌的新器官。
尼霍姆说：“夏威夷短尾鱿鱼已经成为研究共生现象30多年的模式生物。“拥有基因组将有助于研究这些相互作用的研究人员，以及研究生物学不同领域(如动物发育和比较进化)的研究人员。”
许多动物的器官都含有细菌。人体肠道含有数万亿个细菌，这些细菌在消化、免疫功能和整体健康方面发挥着重要作用。了解如何通过识别帮助动物与细菌合作的基因来维持这些关系，为进一步了解人体提供了基础。夏威夷短尾鱿鱼是鉴定这些基因的绝佳模型，因为它与有益微生物具有共生关系，被许多科学家用来研究细菌和动物之间的交流。
夏威夷短尾鱿鱼有两种不同的共生器官，研究人员可以证明这些器官在进化过程中有不同的路径。这种特殊种类的鱿鱼有一个发光器官，其中包含一种发光或生物发光的细菌，这使鱿鱼能够从捕食者那里暴露自己。在过去的某个时候，一个重大的“重复事件”发生了，这导致了通常存在于眼睛中的基因的重复拷贝。这些基因使鱿鱼能够控制细菌产生的光。
另一个发现是，在辅助腺体中，一个雌性生殖器官富含基因，这些基因是“孤儿基因”或只在短尾鱿鱼中发现但在其他生物中没有的基因。
西马科夫说：“鱿鱼和章鱼表现出非常独特的基因组结构，这与其他任何动物都不同。"这证实了之前关于它们不同寻常的性质和复杂性的报道."
福斯特指出，梳理这些异常复杂的细节，直接适用于研究其他细菌/动物的关系。
“微生物是动物及其组织进化的主要驱动因素，”她说。“我们的研究结果将有助于确定那些含有动物微生物的组织的‘起源故事’，并将有助于梳理动物体内这些不同类型创新的可能遗传过程。”
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