研究小鼠模型中无法识别的遗传变异会影响免疫细胞

阿拉巴马大学伯明翰分校的研究人员在Immunity杂志上发表的一项研究报告称，同类小鼠品系——在免疫学研究中使用了数十年，并被认为在标记位点之外具有相同的基因——被发现含有以前未被识别的遗传变异。

由免疫学家 Amy Weinmann 博士和第一作者 Danielle Chisolm 博士领导的团队在对影响进行实验后发现了这种遗传变异。 T 细胞上微生物代谢物的研究给出了相互矛盾的数据，并引发了令人烦恼的问题。

“我们意识到一个未知的实验变量正在影响我们结果的解释，”UAB 微生物学系教授 Weinmann 说。“那时，我们将重点转移到识别那个未知变量上。如果你把研究看作是一个谜题，我们就知道我们错过了一个关键的拼图，如果不先找到我们就不能再进一步了丢失的部分。”

为了找到答案，UAB 的研究人员采用了现有的信息学工具并设计了一种新策略来识别与最常用的小鼠遗传背景不同的基因组区域。他们的新方法将帮助研究人员在感兴趣的染色体区域识别和定义小鼠品系之间的遗传变异。

在这项研究中，Weinmann 及其同事分析了几种被认为在基因标记位点 CD45 之外具有相同基因的小鼠品系。令他们惊讶的是，他们发现基因组的大部分区域都包含遗传变异。这表明这些常用小鼠品系中的遗传内容可能不是研究人员长期以来假设的那样，这可能会影响对这些小鼠模型生成的数据的解释。

“差异包括包含在免疫细胞归巢、T 细胞耗竭、T 和 B 细胞分化以及先天免疫反应中具有免疫学重要性的基因的区域，”Weinmann 说。此外，CD45 基因周围遗传物质变异的数量和位置在三个主要的生物医学研究小鼠供应商销售的品系中有所不同。因此，UAB 研究的影响远远超出了他们最初的微生物组实验，它提醒使用小鼠模型的研究人员在他们的实验中注意一个意想不到的变量。

因此，该研究为研究人员提供了有关免疫学研究中广泛使用的小鼠模型的遗传内容的宝贵信息。重要的是，它还提供了一种新策略，研究人员可以使用该策略来定义任何小鼠模型中具有遗传变异的区域。

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