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了解细菌系统生物学的更新框架

导读 但很长一段时间以来,科学家们发现将细菌细胞视为平均是很方便的。传统上,研究人员依靠种群水平的策略来了解细菌生理学的基本方面。这些种

但很长一段时间以来,科学家们发现将细菌细胞视为“平均”是很方便的。

传统上,研究人员依靠种群水平的策略来了解细菌生理学的基本方面。这些种群水平的方法描述了理想化平均细胞的行为,它们是细菌生长的主流模型的基础。

基于平均细胞的模型很有用,但它们可能无法准确描述单个细胞的实际工作方式。单细胞活体成像技术的出现开辟了新的可能性。现在可以窥探单个细胞的生命。在PLOS Genetics的一篇新论文中,来自圣路易斯华盛顿大学和普渡大学的一组生物学家和物理学家使用实际的单细胞数据创建了一个更新的框架,用于理解细菌中细胞生长、DNA 复制和分裂之间的关系系统。

Petra Levin 是华盛顿大学艺术与科学学院的 George William 和 Irene Koechig Freiberg 生物学教授,也是这篇新论文的作者,她对单细胞生物学有着浓厚的兴趣。在她的研究工作中,莱文对我们对细菌细胞生长的理解做出了开创性的贡献。

在阿斯彭物理中心的一次偶然相遇促成了与 Srividya Iyer-Biswas 的合作,Srividya Iyer-Biswas 是普渡大学的物理学家,在基于第一性原理的物理理论和高精度单细胞实验方面具有专业知识。

利用大流行初期带来的 Zoom 时代,Levin 和 Iyer-Biswas 开展了他们的虚拟合作,以重新审视一些“细菌细胞周期的美丽、经典模型”,正如 Levin 所描述的那样。

他们发现缺少令人兴奋的部分。

问题是什么?这些模型依赖于群体中“平均”细胞的行为。但是使用平均值来推断实际细胞的行为可能会产生误导。

“想象一下,每一种细菌都在按照自己的节奏唱着自己异想天开的曲子,”Iyer-Biswas 说。“集体——由数百万个细胞组成的群体——有自己的音乐,没有任何一个声音特别突出,但一首歌还是出现了。仅仅听到集体的演绎,一个人怎么可能发现一个人的歌到底能表达什么?是吗?这就是我们面临的问题。”

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