分子相互作用的方式构成了生命和治疗疾病的基础。但是，当病毒蛋白与药物中的分子相遇并结合时，它会是什么样子的呢?欧洲研究理事会已经资助了65万丹麦克朗，现在旨在揭示这一迄今为止看不见的过程。
团队成员在项目规划期间休息。图中：隆德大学的MikaelAkke，哥本哈根大学的KrestenLindorff-Larsen和汉堡埃彭多夫大学医学中心的Eike-ChristianSchulz。照片：朱利奥·特塞
蛋白质对于使生命成为可能的每个过程都是必不可少的。因此，了解它们的工作原理至关重要。例如，当它们允许药物通过与组成药物的分子结合而起作用时。到目前为止，这是一个至关重要的过程，几乎不可能通过实验直接观察到，尽管已经努力使用有点僵化的计算机模型来模仿它。
我们目前将蛋白质描述为静态分子限制了我们理解它们的能力。它们在不同状态之间自发过渡，其中一些运动很少见，传统研究方法通常看不见。这项研究项目将为看不见的过程提供新的线索，以便我们对它们有更深入的了解，以及当一种蛋白质与另一种分子结合时会发生什么。
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实际上，研究人员将研究HIV和SARS-CoV-2等病毒中的蛋白质如何与细胞中天然存在的分子结合，就像药物中的分子一样。目的是绘制蛋白质的结构和能量在结合过程中如何变化。
为了研究蛋白质世界中这些微小的结合过程，有必要结合几种测量方法，每个参与的研究团队都是其中的专家。生物系正在提供分子模拟和其他计算工具，隆德大学正在进行核磁共振波谱学，汉堡擅长时间分辨X射线晶体学。
“你可以说我们正在将结构生物学带入蛋白质动力学的新时代，在这个时代，有必要结合我们的各种方法来理解和量化所有细节。一种方法为另一种方法提供了有价值的信息，通过组合和整合这些方法，我们可以共同为创造关于蛋白质和较小分子如何相互作用的全新知识做出贡献，“KrestenLindorff-Larsen说。
根据研究人员的说法，结果可以与描述分子和蛋白质如何相互结合的高级分子薄膜进行比较。研究人员希望获得新的见解，了解药物分子与体内蛋白质结合需要多长时间以及分子在那里停留多长时间。从长远来看，这些知识可能会导致独特设计和更有效的药物。
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