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寻找最有效药物的软件程序有助于个性化癌症治疗

精准医学力求使治疗适应每位患者的特点。基因组研究正在提供越来越多的数据来实现这一目标,但这种非常丰富的信息阻碍了这项任务:医生必须解释大量的基因改变,而只有少数与诊断每种癌症的类型和阶段有关,并决定如何对待它。

为了促进这项任务,国家癌症研究中心 (CNIO) 的生物信息学部门和维哥大学刚刚启动了 PanDrugs2 软件程序,该程序生成报告以促进临床决策。

PanDrugs2 分析每个患者的基因组数据以寻找分子靶点,换句话说,现有药物作用于的分子。该平台为相关基因计算一个评分系统,为可能对它们起作用的药物计算另一个评分系统。获得最高分的药物具有最充分的科学证据,可以有效对抗在患者体内检测到的治疗靶点。根据这些分数,该工具生成治疗排名

该平台总共处理 4,642 个基因和 14,659 种独特化合物的数据。基于这些信息,它在药物和基因之间产生了 74,000 个关联。

PanDrugs2 的开发由 CNIO 生物信息学部门负责人 Fátima Al-Shahrour 和 CINBIO 新一代信息系统小组研究员维哥大学的 Daniel Gonzalez Peña 共同指导。PanDrugs2 刚刚被刊登在《核酸研究》杂志上。

“PanDrugs2 旨在帮助巩固临床实践中的精准医学,”CNIO 生物信息学部门的研究员、该论文的合著者 Gonzalo Gómez-López 说。“我们一直在寻找一种清晰的显示格式,让专业人士非常容易理解,但仍然详尽无遗。我们希望迄今为止所有可用的知识都可用于医疗咨询。”

批准的、试验的和试用的药物

PanDrugs2 改进了五年前发布的旧版 PanDrugs 平台。例如,它是第一个考虑遗传(或生发)突变以及受孕(或体细胞)后产生的突变的平台。这是精准医学的重要信息,因为遗传突变“导致个体之间在所需药物剂量方面的差异。或者导致一种物质比另一种物质更有效,”Gonzalo Gómez-López 解释说。

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