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全新 FREM 平台可实现 98% 的快速筛查和基因分型准确率

导读 疟疾是由疟原虫引起的全球健康问题,需要精确的检测和基因分型才能有效控制。主要诊断技术是核酸扩增检测;然而,它们的广泛部署在资源有限...

疟疾是由疟原虫引起的全球健康问题,需要精确的检测和基因分型才能有效控制。主要诊断技术是核酸扩增检测;然而,它们的广泛部署在资源有限的环境中造成了障碍。

CRISPR/Cas 系统已经改变了分子诊断,但它们经常需要两个独立的阶段,使程序复杂化并阻碍了普遍实施。

使用有限的系统会增加生物相容性困难并可能降低检测效率。准确的基因分型对于疟疾治疗和控制工作至关重要。

关于该研究

在本研究中,研究人员评估了微流体平台同时进行疟疾筛查和疟原虫基因分型的功效。

对于疟疾感染筛查和疟原虫基因分型,微流控平台将重组酶聚合酶扩增 (RPA) 与基于簇的规则间隔短回文重复序列 (CRISPR) 的检测相结合。

研究人员为五种疟原虫物种创建了通用和物种特异性 CRISPR RNA (crRNA) 候选物,每种都有一个原型间隔子相邻基序 (PAM) 来识别 Cas12a。从所有受试者身上采集血液样本,并将 RPA试剂与蔗糖在试管中混合,然后注入 CRISPR 设备。

靶向疟原虫保守序列的 crRNA 用于疟疾感染检测。在每个 Cas12a 介导的实验中,使用了针对恶性疟原虫、三日疟原虫、卵形疟原虫、间日疟原虫和诺氏疟原虫不同基因座的 5 种 CRISPR RNA。使用能够串联评估六个目标的微流体系统来完成疟疾诊断。

使用三维打印机创建尺寸为 7.2 毫米(高)× 26 毫米(直径)的微流控芯片来完成多重检测。Cas12a 系统 (n=6) 被放置在各自的室中,每个室都含有疟原虫和其他物种的不同 CRISPR RNA。

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