布法罗大学研究人员的新发现表明,RNA 编辑在人类生物学和人类疾病发展中发挥的作用可能比人们普遍理解的更大。
在 5 月 4 日发表在《通讯生物学》上的一篇文章中,该研究的作者得出结论,这项研究为更细致地了解分子生物学的工作原理提供了证据,特别是在蛋白质和基因如何应对环境挑战方面。
RNA 编辑位点会导致转录基因中单核苷酸多态性(SNP)(人类最常见的遗传变异类型)发生变化,从而导致不同蛋白质的编码。这些不同蛋白质的表达反过来可能是多种人类疾病的一个因素。
改变生物学
“外部现象可以改变你的生物学特性,从而改变你对所面临的挑战的反应方式,无论是传染病还是气候变化,”通讯作者、布法罗大学雅各布医学与生物医学科学学院生物医学信息学系教授兼系主任 Peter L. Elkin 医学博士解释道。
他继续说,面对这些类型的挑战,干扰素会上调,从而刺激 APOBEC 酶(一类编辑 RNA 的酶)的释放。
这项研究主要针对这一酶家族。Elkin 团队发现,导致 DNA 发生特定类型变化的 SNP 中有 4.5% 可能是 RNA 编辑的位点。作者表示,即使这种类型的 RNA 编辑发生在这些位点中的一小部分,也可能对人类健康产生重大影响。
先前的研究表明,APOBEC 介导的 RNA 编辑与某些自身免疫和神经系统疾病之间存在某种关系。Elkin 补充说,大约 70% 的遗传性神经系统疾病涉及至少一个 RNA 编辑位点。
“我们发现基因组中的特定区域容易受到此类变化的影响,”他说,这表明 RNA 编辑位点可能对遗传疾病产生重大影响。
当罗斯威尔帕克综合癌症中心的合作者发现 RNA 编辑位点与特定癌症有关时,研究人员更加感兴趣。
“我开始意识到 RNA 编辑位点在疾病中的作用可能比以前认为的更大,”Elkin 说。
RNA 见
为了发现基因组中所有的 RNA 编辑位点,该团队开发了一种名为 RNAsee 的计算工具,并通过机器学习对其进行了验证。
该工具显示,RNAsee 发现的潜在编辑位点中有 22.7% 被标记为可能致病或致病,而只有 9.2% 被标记为可能良性或良性。
作者写道,这一发现表明他们研究的 RNA 编辑类型“很有可能对人类健康产生负面影响”。
埃尔金在谈到人类表达的完整蛋白质组时说:“这项研究为我们理解蛋白质组如何发展提供了另一个维度。”
他补充说,这项研究的下一步将是让那些研究特定疾病遗传学的研究人员对已经发现的 RNA 编辑位点进行跟踪研究。
埃尔金说:“我希望研究人员能够在我们发现 RNA 编辑位点的地方开展后续基础实验,观察感兴趣的基因。”
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