CRISPR 工具箱的新成员:教基因剪刀检测 RNA
CRISPR-Cas 系统是细菌的防御系统,已成为分子诊断技术的丰富来源。位于维尔茨堡的亥姆霍兹 RNA 感染研究所 (HIRI) 的研究人员扩展了这个广泛的工具箱。他们开发了一种名为 PUMA 的新方法,能够使用 Cas12 核酸酶检测 RNA,而 Cas12 核酸酶自然靶向 DNA。PUMA 有望实现广泛的应用和高精度。
研究团队在《自然通讯》杂志上发表了其研究成果。
细菌已经发展出特殊的防御机制来保护自己免受病毒的侵害,而病毒绝不仅仅感染人类。作为这些所谓的 CRISPR-Cas 系统的一部分,CRISPR核糖核酸(crRNA) 充当“向导 RNA”,可识别外来基因组的区域,例如病毒 DNA。然后,由 crRNA 引导的 CRISPR 相关 (Cas) 核酸酶会像剪刀一样将其剪断,使其无害。
人类已经利用了这一策略:“CRISPR 通常被称为‘基因剪刀’,是许多分子技术的基础,”维尔茨堡亥姆霍兹 RNA 感染研究所 (HIRI) RNA 合成生物学系主任 Chase Beisel 说。该研究所是布伦瑞克亥姆霍兹感染研究中心 (HZI) 的一个基地,与维尔茨堡朱利叶斯马克西米利安大学 (JMU) 合作,Beisel 是该大学的教授。
2021 年,Beisel 实验室与 JMU 合作开发的诊断平台 LEOPARD 也利用了 CRISPR 技术。LEOPARD 有可能在一次测试中检测出多种与疾病相关的生物标志物。该方法基于重编程 RNA 因子,即所谓的 tracrRNA。这些 RNA 自然参与帮助产生 Cas9 和不同 Cas12 核酸酶使用的向导 RNA。
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