中国科学院中国科学技术大学(USTC)光守红教授课题组与中国科学技术大学附属第一医院冯学珠教授合作,揭示了基于Caenorhabditis的核仁RNA干扰线虫(C. elegans) 作为模式生物。该研究发表在《核酸研究》上。
siRNA是一种长度约为22个核苷酸的非编码小RNA。siRNA在动植物体的生长发育、生殖遗传和免疫防御等方面发挥着重要作用,是一种优良的药物分子。
光教授课题组通过正向和反向遗传筛选,鉴定了一系列抑制秀丽隐杆线虫内源性siRNA产生的siRNA抑制因子(SUSI)。当 SUSI 因子有缺陷时,错误加工的核糖体 RNA (rRNA) 片段会在细胞中积累,从而诱导核糖体 siRNA (risiRNA) 的产生。risiRNAs 通过激活核 RNA 干扰通路来补充 rRNA 序列并调节 rRNA 的水平。
在这项研究中,研究人员通过基因筛选克隆了一个抑制risiRNA产生的SUSI-5基因,发现SUSI-5基因编码了一个保守的RNA外泌体催化亚基DIS-3。
通过CRISPR基因编辑技术,他们证实RNA外泌体任何亚基的功能缺陷都可能导致risiRNA的积累,而risiRNA诱导两个核RNA干扰关键因子NRDE-2和NRDE-3进入核仁,结合核糖体RNA 前体,进而抑制 RNA 聚合酶的转录活性。
此外,研究人员还发现,RNA外泌体可以通过亚细胞定位的变化来响应细胞核内rRNA的稳态。RNA外泌体在多种RNA的加工和代谢中起重要作用,主要位于核仁中。细胞内 rRNA 稳态失衡会导致 RNA 外泌体从核仁转移到核质。RNA外泌体的正确亚细胞定位在抑制risiRNA的产生中起着重要作用。
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