新构建的慢性淋巴细胞白血病 (CLL) 遗传变化图谱是一种血液和骨髓癌症，以多种形式存在并由各种原因引起，可以更好地了解这种可能导致的复杂恶性肿瘤为患者提供更准确的预后、改进的诊断方法和新的治疗方法。这项工作发表在《自然遗传学》上，由国际研究人员合作进行，其中包括来自麻省总癌症中心、达纳-法伯癌症研究所以及麻省理工学院和哈佛博德研究所的团队。
CLL 以缓慢或快速生长的癌症形式存在，并与某些基因突变有关，但尚未完全表征。以前的分析只提供了 CLL“地图”的片段，每个都侧重于特定类型的患者或有限的数据。为了更透彻地了解 CLL 及其分子亚型的生物学基础，科学家们着手从迄今为止最大的 CLL 数据集构建地图。
为了构建 CLL 图，该团队分析了来自 1,148 名患者的基因序列、基因表达模式和对 DNA 或基因组、转录组和表观基因组数据的化学修饰的变异。“这样的 CLL 图最终可以在临床中使用，其中新患者的基因组特征可以与具有相似遗传特征的患者的治疗和结果进行比较，”共同高级和共同通讯作者 Catherine Wu 医学博士说，达纳-法伯癌症研究所干细胞移植和细胞治疗部主任，哈佛医学院医学教授。“这种分析可能有助于根据新患者的特定分子特征更准确地调整预后和治疗，从而更接近精准医学。”
科学家们确定了 202 个基因(其中 109 个是新基因)，这些基因在发生突变时可能会驱动 CLL，他们改进了具有不同基因组特征和预后的 CLL 亚型的表征。除了基因序列，某些基因的表达模式进一步细分了 CLL 并提供了有价值的预后信息。“我们的研究表明，CLL 的遗传和生物学情况比以前认为的要复杂得多，”麻省总癌症中心生物信息学主任和医学研究中心主任、共同通讯作者 Gad Getz 博士说。 Broad研究所的癌症基因组计算分析小组。
患者的临床结果与基因组、转录组和表观基因组特征的组合相关，因此整合这些数据可以预测患者出现缓解与发展为更晚期癌症的可能性。
“我们正在发布一个基于 CLL 地图的 CLL 地图‘门户’，它将成为一个交互式网站，供转化研究人员用作进一步调查的资源——例如了解更多关于不同驱动因素和 CLL 亚型的信息，”说盖茨。
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