据发表在《蛋白质组研究杂志》上的一项新研究，深入研究在小鼠模型中生长的人类肿瘤的蛋白质和蛋白质活性，可以扩展治疗髓母细胞瘤的潜在治疗途径。
作为研究的一部分，希望之城的一部分，桑福德伯纳姆Prebys医学发现研究所和加州大学圣地亚哥分校的转化基因组学研究所(TGen)的研究人员之间的合作提供了一个机制解释，为什么药物放线菌素D可能是治疗3组髓母细胞瘤的有用候选者 - 基于先前药物筛选研究的结果。
髓母细胞瘤是最常见的恶性小儿脑肿瘤，有四种主要的分子亚型。第3组肿瘤预后较差，五年生存率为50%。研究人员指出，迫切需要更有效的治疗方法以及对所有髓母细胞瘤具有较少毒副作用的治疗。
为了寻找新的治疗靶点，TGen博士后研究员Kristin Leskoske博士和她的同事研究了从20名具有不同亚型疾病的髓母细胞瘤患者身上取出的细胞在小鼠中生长的肿瘤。由此产生的肿瘤被称为原位患者来源的异种移植物或PDX模型。
“关于髓母细胞瘤的PDX模型是否足够接近原发性人类肿瘤以进行研究和药物测试，该领域一直存在一些争论，”Patrick Pirrotte博士，TGen副教授，转化质谱合作中心主任和该论文的资深作者说。
他补充说，这项研究的重要结论之一是“从蛋白质组学的角度来看，这些PDX肿瘤与实际的患者肿瘤非常相似，可以用作疾病的模型。
直接在小鼠大脑中生长的细胞，而不是像有时那样在实验室的培养皿中生长，或者作为小鼠侧翼的植入物，“更接近地模仿肿瘤通常生长的环境，”该论文的第一作者Leskoske博士说。
然后，研究人员深入分析了髓母细胞瘤蛋白质组，测量了每个PDX模型中每种蛋白质的量，并鉴定了蛋白质上的化学修饰，称为磷酸化，这表明蛋白质的活性水平。
使用这些蛋白质谱，Leskoske博士及其同事能够将某些蛋白质的丰度或活性与它们对特定药物的敏感性相关联。例如，桑福德伯纳姆佩雷布斯医学发现研究所的合著者Robert J. Wechsler-Reya博士之前的一项研究表明，3组髓母细胞瘤对放线菌素D敏感，但这种敏感性的原因尚不清楚。
“药物筛查可识别漏洞;他们没有确定他们的作用机制。我们的补充蛋白质组学研究提出了放线菌素D敏感性的潜在机制，“Pirrotte博士说。
3族髓母细胞瘤最常见的分子特征是MYC的扩增。在这项研究中，研究人员发现放线霉素D的敏感性与MYC和MYC靶向基因的丰度增加之间存在显着关联。
研究中许多对放线菌素D敏感的蛋白质是线粒体蛋白质，它们是调节细胞代谢的关键。Pirrotte博士说，该团队还有其他未发表的数据，结合这些发现，表明某些代谢脆弱性可能靶向第3组肿瘤。
“MYC也是除髓母细胞瘤以外的其他癌症中众所周知的癌蛋白，”Wechsler-Reya博士说。目前研究的结果应该鼓励我们研究在这些MYC驱动的癌症中抑制线粒体功能的方法。
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