在最近发表在PLoS病原体杂志上的一项研究中，研究人员分析了贴壁侵袭性大肠杆菌(AIEC)的LF82菌株的噬菌体，以更好地了解它们在体外和巨噬细胞内的行为。
像溶原这样的噬菌体可以直接整合到宿主细菌的基因组中，也可以作为自由复制的生物体存在。噬菌体基因的表达，也称为“白痴”，为细菌提供了有利的特性，包括防止其他致病物种或适应某些环境的能力，仅举几例。
相反，诱导噬菌体进入细菌可能会引起压力，最终导致噬菌体裂解。因此，必须进一步了解噬菌体的广泛行为，特别是在考虑它们对细菌病原体的潜在影响时。
例如，AIEC基因组承载着许多不同的噬菌体，LF82菌株编码五个功能性噬菌体。LF82噬菌体1已在克罗恩病患者获得的大肠杆菌菌株中报道。
与实验室条件下的活性相比，Lambda噬菌体诱导在富含巨噬细胞的环境中增加26倍。这种高诱导水平导致约90%的大肠杆菌裂解，这可能直接归因于巨噬细胞活性。
关于研究
五个LF82噬菌体被命名为Gally(Prophage 1)，Perceval(Prophage 2)，Tritos(Prophage 3)，Cartapus(Prophage 4)和Cyrano(pLF82)。这些噬菌体被上传到欧洲核苷酸档案数据库，并重新注释。
在体外LF82转录组分析中，转录比局部转录率高五倍于主调节器或典型噬菌体基因的基因被鉴定为白痴。评估了截至 82 年 2020 月的大肠杆菌 LF<> 噬菌体与 NCBI 参考噬菌体之间的同源性。
核糖核酸(RNA)测序数据用于转录组学和差异基因表达分析。此外，为了检测噬菌体中自发病毒的产生，对包衣膜的病毒组脱氧核糖核酸(DNA)进行了全基因组测序分析。
此外，通过定量聚合酶链反应(qPCR)测量病毒粒子基因组，以验证体外Gally患病率。最后，将噬菌体作为斑块繁殖，随后通过透射电子显微镜(TEM)进行检查。
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