来自巴塞罗那大学、加泰罗尼亚高等化学研究所(IQAC-CSIC)、巴塞罗那微电子研究所(IMB-CNM-CSIC)和阿拉贡纳米科学与材料研究所(INMA)的专家CSIC 和萨拉戈萨大学——开发了一种基于三链体形成探针技术的 RNA 病毒检测新方法。这种创新方法为检测 SARS-CoV-2、甲型流感病毒 (H1N1) 或呼吸道合胞病毒 (RSV) 等病毒开辟了新的选择,RSV 是一种影响新生儿的病原体,需要仔细鉴别诊断。
这项跨学科研究发表在国际分子科学杂志上,由巴塞罗那大学药学与食品科学学院和纳米科学与纳米技术研究所 (IN2UB) 的 Carlos J. Ciudad 和 Verónica Noe 领导;Ramón Eritja、Anna Aviñó、Lluïsa Vilaplana 和 M. Pilar Marco,来自 IQAC-CSIC 和 CIBER 的生物工程、生物材料和纳米医学 (CIBER-BBN);来自 IMB-CNM-CSIC 的 Manuel Gutiérrez、Antoni Baldi 和 César Fernández,以及纳米科学与材料研究所和 Aragón INMA (CSIC-UNIZAR) 和 CIBER-BBN 的 CSIC 研究人员 Valeria Grazu 和 Jesús Martínez。
该研究是在 PoC4CoV 项目的背景下进行的,该项目由 M. Pilar Marco 和 César Fernández 领导,并由 CSIC 的全球健康平台 (PTI) 资助。作为由 La Marató de TV3 2020 资助的一个项目的一部分,这项研究继续进行,以对抗 COVID-19,UB 化学学院的专家也参与了该项目。
聚嘌呤发夹捕获病毒 RNA
新方法基于 UB 癌症治疗小组设计的聚嘌呤发夹 (PPRH) 捕获病毒 RNA 并形成高亲和力三链体的能力。当这种混合结构连接到分子探针并与受影响患者的样本接触时,就会获得病毒因子的检测信号。科学出版物中介绍的方法称为三重增强核酸检测分析 (TENADA)。
“PPRHs 是未修饰的单链 DNA 发夹,由两个反平行多嘌呤的镜面结构域组成。这些结构域通过胸苷环相互连接,通过分子内反向 Hoogsteen 键连接。分子发夹可以特异性结合单链聚嘧啶序列-链 DNA (ssDNA)、双链 DNA (dsDNA) 或 RNA 病毒通过 Watson-Crick 键,从而形成反平行三链体”,UB 生物化学与生理学系的 Carlos J. Ciudad 教授说。
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