导读 癌症驱动基因是那些具有对肿瘤发展和扩散至关重要的突变的基因。在 ICREA 研究员 Patrick Aloy 的带领下，来自巴塞罗那 IRB 结构生...
癌症驱动基因是那些具有对肿瘤发展和扩散至关重要的突变的基因。在 ICREA 研究员 Patrick Aloy 的带领下，来自巴塞罗那 IRB 结构生物信息学和网络生物学 (SBNB) 实验室的科学家们开发了一个计算管道，可以预测肿瘤对不同癌症治疗的反应。该系统基于对复杂反应标记的识别，这些标记源自携带突变的癌症驱动基因之间的共现模式。它已经通过实验和乳腺癌患者的数据进行了测试，在预测这些反应方面达到了 66% 的准确率。
鉴于其在肿瘤发展中的关键作用，癌症驱动基因在近几十年来得到了广泛的研究。了解哪些基因在特定肿瘤中受到影响可以帮助为该患者确定最合适的治疗策略，这种方法被称为精准医学。SBNB 实验室的研究人员首次提出，两个或多个癌症驱动基因的同时发生(或缺乏)改变是预测对某种治疗的反应的关键因素。
“受突变影响的两个或多个癌症驱动基因的总和导致形成复杂的生物标志物网络，改变肿瘤的分子特征并影响其对治疗的反应，”阿洛伊说。“通过这项工作，我们看到从整体上 研究癌症驱动基因，分析不同的组合，可以为精准医学带来巨大进步，”他补充道。
从生物信息学到实验和临床分析
尽管有大量关于癌症基因组的数据，但有关患者治疗干预结果的信息却很少。研究人员从一个公共数据库开始，该数据库收集多种治疗对植入小鼠模型的人类肿瘤生长的影响的信息。基于这些数据，他们选择了 53 种治疗方法(或治疗组合)，并比较了对每种治疗有反应和没有反应的肿瘤的分子特征。
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