来自巴塞罗纳大学遗传、微生物和统计系以及生物医学研究所的研究人员与基因组调控中心(CRG)合作,描述了基因及其表达过程中所需的调控元件。以及组织和器官再生的过程。该研究发表在《基因组研究杂志》封面,通过新一代测序将经典遗传分析与染色质新研究技术相结合,为再生医学提供了新的视角。
这项研究的参与者是埃琳娜维兹卡亚-莫利纳(UB)和塞西莉亚克莱因(UB-CRG),这是由蒙特塞拉特科罗米纳斯(UB)领导的这篇文章的第一位签署人。其他合作者是研究人员罗德里克吉吉戈(CRG,庞贝法布拉大学)、弗洛伦西塞拉(UB)和拉克什米什拉(CCMB,海得拉巴)。
再生基因
在这篇文章中,作者分析了不同再生阶段果蝇翅膀成像盘的转录组。通过对大规模RNA测序的分析,他们鉴定了在这个过程中差异表达的基因。此外,他们发现这些基因中有30%以上位于基因簇中。通过比较和分析其他物种(小鼠和斑马鱼),作者发现了一组参与再生的基因,这些基因在所有这些物种中都是保守的。Elena Vizcaya-Molina指出:“知道哪些基因可以再生——这些基因有一些共同点,这可以帮助我们了解在再生技能更有限的生物(如人类)中,激活这一过程需要什么条件。
“这项研究表明,基因组学和生物信息学对于理解基本生物过程变得越来越重要,”CRG博士后研究员、UB讲师Cecilia Klein说。新的测序技术以及生物信息学分析和实验研究的结合使研究人员能够在理解基因调控方面取得进展,在这种情况下,就是再生。
再生中的调节因素
在这项研究中,研究人员还首次发现了与再生相关的三种调节元素:那些在再生过程中增加活性的元素,那些在其他发育阶段或其他组织中重复使用的元素,最后是再生中独特的元素。“这些调控元件是可以导致和塑造基因表达的DNA序列,”Elena Vizcaya说。此外,作者发现这些元素可能被物种(苍蝇、老鼠和斑马鱼)中的一些保守基因激活。“再生特定调节元件的异位激活可能是提高不能再生器官再生能力的关键工具,”专家Montserrat Corominas总结道。
作为再生的模式动物,苍蝇
自古以来,再生就引起了人们极大的兴趣,比如希腊神话中的传说。然而,被称为果蝇的果蝇的生殖能力直到20世纪40年代才被发现,当时它被一位再生医学之父发现。托马斯摩根看到苍蝇的成像盘(成体表皮结构中的原始盘)被打碎后可以再生。飞行被认为是研究再生的模型。
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